Публикации: автор более 120-ти научных работ, в т.ч. 3-х монографий, 5-ти патентов на изобретение, 1-го учебного пособия.
Основные труды: Алибеков, С.Я. Интенсификация процесса очистки сточных вод от ионов никеля / С.Я.Алибеков, В.В.Фоминых // Инженерная экология. - 2003. - N 3. - С. 55-58; Алибеков, С.Я. Безреагентная очистка цианосодержащих сточных вод / С.Я.Алибеков. - Йошкар-Ола: МарГТУ, 2002. - 78 с.; Алибеков, С.Я. Анализ производственных традиций населения Ветлужско-Вятского региона в I тыс. н.э. / С.Я.Алибеков, А.И.Шадрин // Матер. III Междунар. исторического конгресса фино-угроведов "Формирование, историческое взаимодействие и культурные связи фино-угорских народов". - Йошкар-Ола, 2004. - С. 100-102.