В магаданской области налоги играют роль основного источника формирования государственных финансовых ресурсов. Налоговая политика в регионе недостаточно отработана. В ней необходимо создать такие условия налогообложения, при которых система налогов и технологию их взимания будет более упрощенной. В поиске приемлемых решений налогообложения в 2000 году введены дополнения и изменения в федеральные законы о налоге на прибыль, подоходном налоге с физических лиц, едином вмененном налоге, налоге с продаж. В целях наведения порядка и достижения эффективности в контрольных функциях государства в налоговой политике региона предусматривается упорядочение проверок предприятий малого и среднего бизнеса периодичностью один раз в год. Для этого будет выдаваться Сертификат налогопослушного плательщика Магаданской области, позволяющий проходить налоговую проверку один раз в год. В 2000 году в области многие организации, как участники особой экономической зоны, были освобождены от уплаты федеральных налогов, что должно отразится на подъеме производства и стабилизации социально-экономического положения предприятий. Введены дополнительные налоги на имущество с физических лиц и соответствующие ставки на игорный бизнес.